• PCR digital QX200 (Biorad).
• Bioanalitzador (Agilent 2100).
• Seqüenciador massiu Miseq (Illumina).
• Unitat d'Arrays tecnologia Affymetrix.
• Real-time PCR (CFX96 touch BioRad i Eco Illumina).
• Electroforesi de camp polsant "Chef Mapper XA"

Cartera de serveis:

Les principals aplicacions que actualment ofereix l'IdISBa dins el camp de la genòmica són:

• PCR digital QX200 (BioRad).
  • Quantificació absoluta d'ADN o ARN.
  • Genotip i detecció de mutacions.
• Bioanalitzador (Agilent 2100).
  • Control de qualitat i quantificació de mostres d'ADN i ARN.
• Seqüenciador massiu Miseq (Illumina).
  • 15 Gb i 25 M de lectures per seqüenciació.
  • Seqüenciació de panells ADN-seq i ARN-seq.
  • Preparació i control de qualitat de llibreries per NGS.
• Unitat d'Arrays tecnologia Affymetrix que permet estudis de:
  • Perfils d'expressió d'ARN (missatger i no codificant).
  • Perfils d'expressió de micro-ARN.
  • Estudis d'expressió d'isoformes "Splicing".
  • Estudis de citogenètica d'alta resolució per a l'anàlisi de pèrdues i guanys, així com absència d'heterozigositat.
• Real-time PCR (CFX96 touch BioRad i Eco Illumina).
• Electroforesi de camp polsant "Chef Mapper XA".
• Anàlisi bioinformàtica de les bases de dades genòmiques:
  • Estudis d'expressió diferencial de gens, miRNAs i lncRNAs.
  • Estudis de correlació expressió miRNA-mRNA.
  • Estudis d'enriquiment funcional i identificació de pathways alterades en el context clínic.
  • Interpretació de resultats.

L'objectiu de la plataforma és oferir una anàlisi completa de les mostres des que es preparen fins que se n'interpreten els resultats. La plataforma ofereix suport i assessorament tècnic i bioinformàtic a aquells usuaris que ho demanin.

Ubicació:

La plataforma de Genòmica i Bioinformàtica de l'IdISBa està ubicada al mòdul F de la planta -1 de l'Hospital Universitari Son Espases.



Personal de contacte: