La plataforma de Genómica y Bioinformática del IdISBa nace con la finalidad de dar soporte a la investigación que incorpora en sus proyectos estudios genéticos.
En este sentido, la plataforma de Genómica y Bioinformática ofrece a los investigadores tecnologías avanzadas para el estudio completo del genoma, desde la transcriptómica y su regulación, hasta el estudio estructural (variación número de copia) a nivel de genoma completo, así como también el análisis bioinformático de las bases de datos generadas en dichos estudios genómicos.
Equipamiento:
- PCR digital QX200 (Biorad).
- Bioanalizador (Agilent 2100).
- Secuenciador masivo Miseq (Illumina).
- Unidad de Arrays tecnología Affymetrix.
- Real-time PCR (CFX96 touch BioRad y Eco Illumina).
- Electroforesis de Campo pulsado "Chef Mapper XA"
Cartera de servicios:
Las principales aplicaciones que actualmente ofrece el IdISBa dentro del campo de la genómica son:
- PCR digital QX200 (BioRad).
- Cuantificación absoluta de ADN o ARN.
- Genotipado y detección de mutaciones.
- Bioanalizador (Agilent 2100).
- Control de calidad y cuantificación de muestras de ADN y ARN.
- Secuenciador masivo Miseq (Illumina).
- 15 Gb y 25M de lecturas por secuenciación.
- Secuenciación de paneles ADN-seq y ARN-seq.
- Preparación y control de calidad de librerías para NGS.
- Unidad de Arrays tecnología Affymetrix que permite estudios de:
- Perfiles de expresión de ARN (mensajero y no codificante).
- Perfiles de expresión de micro-ARN.
- Estudios de expresión de isoformas "Splicing".
- Estudios de citogenética de alta resolución para el análisis de pérdidas y ganancias, así como ausencia de heterocigosidad.
- Real-time PCR (CFX96 touch BioRad y Eco Illumina).
- Electroforesis de Campo pulsado "Chef Mapper XA".
- Análisis bioinformático de las bases de datos genómicas:
- Estudios de expresion diferencial de genes, miRNAs y lncRNAs.
- Estudios de correlación expresión miRNA-mRNA.
- Estudios de enriquecimiento funcional e identifciacion de pathways alteradas en el contexto clinico.
- Interpretación de resultados.
El objetivo de la plataforma es ofrecer un análisis completo de las muestras desde su preparación hasta la interpretación de los resultados. La plataforma ofrece soporte y asesoramiento técnico y bioinformático a aquellos usuarios que lo demanden.
Ubicación:
La Plataforma de Genòmica y Bioinformática del IdISBa está ubicada en el módulo F de la planta -1 del Hospital Universitari Son Espases.
Personal de contacto: